Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAB40BQ12829 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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RAB40BQ12829 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAB40BQ12829 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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RAB40BQ12829 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
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RAB40BQ12829 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAB40BQ12829 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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