Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tor1aQ9ER39 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms