Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kif3aP28741 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Kif3aP28741 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms