Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RABGEF1Q9UJ41 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
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RABGEF1Q9UJ41 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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RABGEF1Q9UJ41 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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RABGEF1Q9UJ41 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
RABGEF1Q9UJ41 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RABGEF1Q9UJ41 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
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