Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
GGA3Q9NZ52 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
GGA3Q9NZ52 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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