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Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5
UBQLN4, Ubiquilin-4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.634-201
ENST00000364811
113 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.293-201
ENST00000364908
93 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-47P-201
ENST00000383866
107 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-144P-201
ENST00000383951
107 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-890P-201
ENST00000384121
107 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-310P-201
ENST00000384655
107 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MT-TT-201
ENST00000387460
66 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNA5SP261-201
ENST00000410536
106 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.622-201
ENST00000411091
108 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD67.1-201
ENST00000516618
108 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AP000676.1-201
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52 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AC013791.1-201
ENST00000616619
62 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AC048344.4-201
ENST00000619744
527 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AC093726.3-201
ENST00000637588
150 nt
BASIC
-0.56
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR367-201
ENST00000362299
68 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.294-201
ENST00000364916
102 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1336P-201
ENST00000383886
109 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-449P-201
ENST00000383914
107 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.453-201
ENST00000384223
109 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.462-201
ENST00000384268
102 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
SNORA20-201
ENST00000384662
132 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-21P-201
ENST00000384710
107 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR204-201
ENST00000385200
110 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-721P-201
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105 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
SNRPGP8-201
ENST00000454064
226 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU7-195P-201
ENST00000458793
62 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-507P-201
ENST00000516045
100 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU7-137P-201
ENST00000516788
62 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU7-35P-201
ENST00000517174
62 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR5692C2-201
ENST00000577959
77 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR4724-201
ENST00000579485
89 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR4662B-201
ENST00000579498
81 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
UBE2V2P2-201
ENST00000587677
504 nt
BASIC
-0.57
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.24-201
ENST00000362508
103 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD114-25-201
ENST00000363742
72 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.229-201
ENST00000364347
113 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-484P-201
ENST00000384016
107 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.424-201
ENST00000384063
103 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-154P-201
ENST00000384306
106 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD116-1-201
ENST00000384335
95 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-102P-201
ENST00000384485
104 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR635-201
ENST00000384830
98 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR519E-201
ENST00000385075
84 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR196A1-201
ENST00000388006
70 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
TRAJ57-201
ENST00000390482
63 nt
APPRIS P1
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AL603914.1-201
ENST00000401964
204 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AJ239322.2-201
ENST00000421696
575 nt
TSL 5
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
PMCHL1-202
ENST00000423102
261 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AC098614.3-201
ENST00000438957
440 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AL035634.1-201
ENST00000446768
372 nt
TSL 2
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.648-201
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110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR4500-201
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76 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR548H5-201
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60 nt
BASIC
-0.58
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.80-201
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BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
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68 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU5E-4P-201
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120 nt
BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.485-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
TRAJ48-201
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APPRIS P1
BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
snoU13.13-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
AC074198.2-201
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1046P-201
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-699P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
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246 nt
BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
MIR5197-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.772-201
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BASIC
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□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
DLEU2_5.2-201
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BASIC
-0.59
□□□□□ -2.5
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1188P-201
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107 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNY3-201
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-1062P-201
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107 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.433-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-524P-201
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107 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.471-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-429P-201
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
MIR559-201
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96 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
SNORA53-201
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249 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-370P-201
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
AL500527.2-201
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
LINC01755-201
ENST00000455010
453 nt
TSL 2
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
MIR1270-201
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-138P-201
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107 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
Y_RNA.661-201
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99 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
SCARNA20.2-201
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
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UBQLN4
Q9NRR5
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
PART1_1.1-201
ENST00000611761
217 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
AC007485.1-201
ENST00000616755
206 nt
BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
AC069503.3-201
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BASIC
-0.6
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
SNORD114-29-201
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70 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNY4P3-201
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95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.51
UBQLN4
Q9NRR5
RNU6-662P-201
ENST00000384253
104 nt
BASIC
-0.61
□□□□□ -2.51
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