Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW00

VSTM4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4Q8IW00 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
VSTM4Q8IW00 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.08□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
VSTM4Q8IW00 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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