Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TPRNQ4KMQ1 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
TPRNQ4KMQ1 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
TPRNQ4KMQ1 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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