Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIDA1Q1XH10 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIDA1Q1XH10 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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