Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
NRF1Q16656 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NRF1Q16656 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.5 ms