Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
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SCN9AQ15858 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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SCN9AQ15858 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
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SCN9AQ15858 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
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SCN9AQ15858 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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SCN9AQ15858 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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SCN9AQ15858 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SCN9AQ15858 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SCN9AQ15858 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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