Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 snosnR66.1-201ENST00000391095 99 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHD4Q14839 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
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CHD4Q14839 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
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CHD4Q14839 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHD4Q14839 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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