Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SSPNQ14714 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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