Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SCARB2Q14108 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SCARB2Q14108 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SCARB2Q14108 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms