Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
CHAF1AQ13111 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
CHAF1AQ13111 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms