Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RDH8Q9NYR8 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.4 ms