Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ZNF260Q3ZCT1 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZNF260Q3ZCT1 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 213.9 ms