Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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CCDC142Q17RM4 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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CCDC142Q17RM4 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CCDC142Q17RM4 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
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