Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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SCN9AQ15858 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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SCN9AQ15858 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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SCN9AQ15858 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SCN9AQ15858 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SCN9AQ15858 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
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SCN9AQ15858 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SCN9AQ15858 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
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