Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SSPNQ14714 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SSPNQ14714 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SSPNQ14714 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.6 ms