Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEMA3AQ14563 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SEMA3AQ14563 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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