Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.5 ms