Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
USP49Q70CQ1 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
USP49Q70CQ1 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
USP49Q70CQ1 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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