Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SKIDA1Q1XH10 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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