Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC142Q17RM4 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CCDC142Q17RM4 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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