Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SCN9AQ15858 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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SCN9AQ15858 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SCN9AQ15858 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
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