Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
RIPK1Q13546 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
RIPK1Q13546 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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