Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FOXD4Q12950 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
FOXD4Q12950 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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