Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.407-201ENST00000383986 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTPN13Q12923 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTPN13Q12923 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.5 ms