Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SCN11AQ9UI33 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SCN11AQ9UI33 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms