Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.35
SGCAQ16586 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SGCAQ16586 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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