Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
VPS72Q15906 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VPS72Q15906 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 344.2 ms