Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
VAMP3Q15836 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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VAMP3Q15836 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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VAMP3Q15836 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
VAMP3Q15836 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
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