Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTPRRQ15256 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PTPRRQ15256 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.3 ms