Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SNX17Q15036 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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SNX17Q15036 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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SNX17Q15036 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNX17Q15036 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNX17Q15036 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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SNX17Q15036 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SNX17Q15036 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
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SNX17Q15036 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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SNX17Q15036 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SNX17Q15036 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
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