Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
VPS72Q15906 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPS72Q15906 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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