Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
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TNFAIP1Q13829 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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TNFAIP1Q13829 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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TNFAIP1Q13829 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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TNFAIP1Q13829 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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TNFAIP1Q13829 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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TNFAIP1Q13829 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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TNFAIP1Q13829 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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TNFAIP1Q13829 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
TNFAIP1Q13829 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
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