Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTPN13Q12923 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
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