Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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SNX17Q15036 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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SNX17Q15036 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SNX17Q15036 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
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SNX17Q15036 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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SNX17Q15036 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNX17Q15036 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SNX17Q15036 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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SNX17Q15036 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SNX17Q15036 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
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SNX17Q15036 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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SNX17Q15036 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
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SNX17Q15036 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
SNX17Q15036 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SNX17Q15036 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SNX17Q15036 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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