Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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