Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPEQ02224 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
CENPEQ02224 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC-2.24□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
CENPEQ02224 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-2.29□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
CENPEQ02224 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.6 ms