Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
SNX17Q15036 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SNX17Q15036 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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SNX17Q15036 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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SNX17Q15036 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
SNX17Q15036 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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