Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SSPNQ14714 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SSPNQ14714 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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