Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGB1Q14028 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGB1Q14028 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.2 ms