Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
UBE3CQ15386 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
UBE3CQ15386 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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