Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
SSPNQ14714 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SSPNQ14714 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSPNQ14714 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SSPNQ14714 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
SSPNQ14714 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SSPNQ14714 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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