Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
IRF5Q13568 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
IRF5Q13568 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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