Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PXDC1Q5TGL8 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PXDC1Q5TGL8 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PXDC1Q5TGL8 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PXDC1Q5TGL8 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
PXDC1Q5TGL8 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PXDC1Q5TGL8 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
PXDC1Q5TGL8 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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