Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
DDX39BQ13838 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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