Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
NipblQ6KCD5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NipblQ6KCD5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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